2020年4月2日,杭州师范大学生命与环境科学学院植物逆境团队在国际经典系统发育期刊Cladistics(IF = 7.78)上发表题为“Chloroplast phylogenomics of liverworts: a reappraisal of the backbone phylogeny of liverworts with emphasis on Ptilidiales”的成果,揭示了苔类植物关键支系间的系统发育关系。
作为早期陆生植物的重要代表,苔类植物的系统发育和形态演化研究对理解植物独立适应早期陆生生态环境具有重要意义。然而,由于样本量及采用的基因片段的局限性及进化本身的复杂性,当前的苔类植物系统框架里仍有部分深度节点存在较大争议。本研究采用浅层测序技术首次对自11个目30科的31个苔类样本进行了叶绿体基因组测序。结合已发表的4个叶绿体基因组,重新构建了苔类植物关键支系间的系统发育关系。本研究的重要结果包括:(1) 证实毛叶苔目和叶苔目的姐妹支系关系(图1); (2) 揭示出GC含量引起的单核苷酸重复序列增加往往会导致系统发育分析结果的偏差(图1, 2)。
此研究得到了国家自然科学基金,英国自然环境研究会及中国科学院大型科学仪器项目的经费支持。我院的俞英博士为论文的第一作者,吴玉环教授和中国科学院西双版纳热带植物研究所的Harald Schneider研究员为共同通讯作者。
图1 基于不同编码策略的苔类植物系统发育框架
图2 GC含量和Poly(G)/(C)在苔类植物系统树上的演化式样
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